院校专业组平行志愿投档是以院校专业组为投档单位，按考生投档分从高分到低分排序，依次检索考生所填院校专业组志愿，符合投档条件的即向该院校专业组投档，如没有符合投档条件的则不能投档。上述过程完成后，无论档案是否投出，均视为该考生已享受了本次平行志愿投档机会。
如果考生投档到某院校某一专业组，选择了服从专业调剂，只能在院校专业组的招生专业范围内进行调剂，不能调剂到其他院校专业组。
如果考生档案投档到某院校专业组后，因故被退出，将不再补投到该次考生所填报的其它院校专业组志愿。
比如：
考生A，全省排名100名。录取系统首先从第1名依次检索到第99名。检索到该生时，首先检索该生填报志愿的01院校专业组，如果01院校专业组投档已满，则该生无法投到该院校专业组；按规则继续检索02院校专业组，如果02院校专业组投档未满，则该生档案投到02院校专业组，计算机不再检索该生的03～40院校专业组志愿。以此类推。如果该生填报的所有院校专业组都无法满足投档条件，则该生的所有平行志愿均无法投档，只能参加征集志愿。录取系统完成对考生A的全部检索后，再处理下一位考生。
需要特别提醒的是，平行志愿实行一次投档，不补充投档。即使投档后因身体条件、单科成绩等原因被退档，无论该考生后续是否还有符合投档条件的志愿，也不再投档，只能参加征集志愿或下一批次录取。
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